1. У петрохемијској индустрији потребна је хидрогенација да би се рафинисала сирова нафта путем одсумпоравања и хидрокрекинга.
2. Друга важна употреба водоника је у хидрогенизацији масти у маргарину, уљима за кување, шампонима, мазивима, средствима за чишћење у домаћинству и другим производима.
3. У процесу високотемпературне обраде у производњи стакла и производњи електронских микрочипова, водоник се додаје заштитном гасу азота да би се уклонио преостали кисеоник.
4. Користи се као сировина за синтезу амонијака, метанола и хлороводоничне киселине и као редукционо средство за металургију.
5. Због високих својстава горива водоника, ваздухопловна индустрија користи течни водоник као гориво.
Напомене о водонику:
Водоник је безбојан, без мириса, нетоксичан, запаљив и експлозиван гас, и постоји опасност од експлозије када се помеша са флуором, хлором, кисеоником, угљен-моноксидом и ваздухом.Међу њима је мешавина водоника и флуора на ниској температури и тами.Околина може спонтано да експлодира, а када је однос запремине мешања са гасом хлора 1:1, може експлодирати и под светлом.
Пошто је водоник безбојан и без мириса, пламен је провидан када гори, па се његово постојање не може лако открити чулима.У многим случајевима, мирисни етанетиол се додаје водонику да би се могао открити мирисом и истовремено дати боју пламену.
Иако водоник није токсичан, он је физиолошки инертан за људско тело, али ако се садржај водоника у ваздуху повећа, то ће изазвати хипоксичну асфиксију.Као и код свих криогених течности, директан контакт са течним водоником ће изазвати промрзлине.Преливање течног водоника и изненадно испаравање великих размера такође ће изазвати недостатак кисеоника у околини и могу формирати експлозивну смешу са ваздухом, изазивајући несрећу са експлозијом сагоревања.